Женская баскетбольная команда МГАФК «Малаховка» была основана в 1993 году. Главным тренером команды является заслуженный тренер России Евгений Викторович Гомельский. Команда выступает в Суперлиге-1 российского женского баскетбола.
В истории команды имеются следующие достижения:
* Чемпион России (2000, 2001, 2002)
* Серебряный призер чемпионата России (1999, 2003, 2004, 2005, 2006, 2007, 2008, 2009, 2010, 2011, 2012)
* Бронзовый призер чемпионата России (2013, 2014, 2015, 2016, 2017, 2018, 2019, 2020)
* Обладатель Кубка России (2000, 2001, 2002, 2003, 2004, 2005)
* Финалист Кубка России (2006, 2007, 2008, 2009, 2010, 2011, 2012, 2013, 2014, 2015, 2016, 2017, 2018, 2019, 2020)
* Обладатель Суперкубка России (2003, 2004, 2005, 2006, 2007, 2008, 2009, 2010, 2011, 2012, 2013, 2014, 2015, 2016, 2017, 2018, 2019, 2020)
* Финалист Суперкубка России (2000, 2001, 2002)
Команда МГАФК «Малаховка» является одним из сильнейших женских баскетбольных клубов России. В ее составе выступает ряд известных игроков, в том числе члены сборной России Алена Данилочкина, Мария Вадеева и Анастасия Логунова.